一.国家政策依据不同：1.根据《中华人民共和国企业所得税法》，内蒙古高新技术企业认证国家高新技术企业认定管理办法是支持和鼓励高新技术企业的发展.《中华人民共和国企业所得税法实施条例》.中国加入了国际组织（WTO）在一系列政策指导和配套政策出台下诞生，主要是规划.引导企业生产.科研.日常制度等标准化符合国家相关战略思路。2.软件企业认定管理办法是国务院鼓励软件产业和集成电路产业发展的若干政策实施意见，进一步促进城市软件产业和集成电路产业发展，结合城市实际情况制定的相关政策。

软件产业是知识经济开元游戏大厅官网的主导产业，对促进经济发展具有重要的战略意义。利用市场机制，优化资源配置，鼓励自主创新.特别支持资金，促进软件产业跨越式发展，保持软件产业在全国的领先地位，尽快达到或接近国际先进水平。

二.不同的政府审批部门

1.高新技术企业由各省认定.自治区.直辖市.内蒙古高新技术企业认证价格计划单列市科技行政管理部门同级财政.税务机关联合评审。

2.软件协会负责双软评估。

三.有效期和年审规定不同

1.高新技术企业有限期为三年，三年复审，第六年重新认定。拟认定的高新技术企业应当按照有关规定报统计和科委备案，同时在当地企业所得税减免所办理减免备案。

2.软件企业实行年度检查，根据软件企业管理办法规定的指标和数据提供相关数据，每年6月前办理软件企业年度检查。通过的，内蒙古高新技术企业认证可以享受上一年度企业所得税减免，不能享受企业所得税减免。